Proyecto Arcimboldo Cloud: Cloud computing con ARCIMBOLDO para una solución de estructuras cristalográficas por supercomputación en la FCSCL

El Proyecto Arcimboldo CloudCloud Computing con Arcimboldo para una solución de estructuras cristalográficas por supercomputación en la FCSCL se ha desarrollado en el proyecto con financiación del CDTI dentro del subprograma Industria de la Ciencia (Código de Proyecto IDC-201001173).

Los métodos cristalográficos han experimentado un desarrollo vertiginoso durante los últimos años a consecuencia de la financiación de grandes proyectos de genómica estructural. Debido a la mayor accesibilidad de la cristalografía, esta ha pasado de ser una técnica altamente especializada a convertirse en una herramienta más rutinaria dentro de la caracterización biológica. Como consecuencia, el perfil del investigador que lleva a cabo una determinación estructural por difracción de rayos X ha evolucionado: cada vez más análisis cristalográficos se llevan a cabo por usuarios sin experiencia y con una preparación en cristalografía limitada, que precisan de sistemas expertos, altamente integrados, capaces de asistirles en su trabajo.

Esta evolución se refleja en la proliferación de interfases y servidores en red que encadenan múltiples herramientas computacionales y llevan a cabo tareas de análisis de datos, resolución de la estructura, construcción del modelo, refino y validación de los resultados, de manera más o menos automática. Requieren del usuario un mínimo de información ya que están diseñadas con un alto grado de sofisticación para poder analizar el problema según los datos facilitados, escoger parámetros razonables y si es necesario computar un gran número de alternativas en paralelo para poder devolver resultados óptimos sin intervención directa de un experto.

Desde su publicación y difusión en septiembre del año pasado, el programa ARCIMBOLDO ha sido licenciado por más de 100 grupos de investigación en todo el mundo. Sin embargo, la necesidad de disponer de una plataforma paralela para explotarlo limita su uso práctico, ya que la mayor parte de los laboratorios cristalográficos no disponen de esta facilidad ni cuentan con suficiente personal informático especializado para implementarla. El ahorro que supondría para tales usuarios externalizar este servicio hace que contratar el tiempo de supercomputación a Catón/FCSC resulte una perspectiva muy competitiva. No solo reduce las necesidades informáticas propias a un ordenador con acceso a Internet sino que está destinado a ahorrar meses de costoso trabajo experimental en el laboratorio. Además, los usuarios industriales podrán subcontratar asesoramiento particularizado a sus intereses.

 

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